Nghiên cứu của anh tích hợp sinh học phân tử tiên tiến và bộ gen với giám sát dịch tễ học và nghiên cứu lâm sàng để giải quyết các bệnh nhiễm trùng do vi khuẩn kháng thuốc ở Việt Nam và trên khắp châu Á.

Anh đã nghiên cứu về bệnh thương hàn ( S . Typhi và S . Paratyphi A), và các bệnh tiêu chảy (ví dụ E. coli, Shigella spp* gây tiêu chảy) từ năm 2008, và gần đây anh đã mở rộng mối quan tâm nghiên cứu của mình về các bệnh nhiễm trùng máu (tức là E. coli, K. pneumoniae ) và nhiễm trùng bệnh viện (tức là A. baumanii, K. pneumoniae ).

Nghiên cứu của anh nhằm cung cấp hiểu biết tốt hơn về quá trình tiến hóa, động lực lây truyền và tác động lâm sàng của vi khuẩn kháng thuốc ở những nơi có thu nhập thấp và trung bình để hướng dẫn các can thiệp y tế công cộng và cải thiện thực hành lâm sàng.

Dự án hiện tại của anh tập trung vào việc kết hợp các thí nghiệm về gen, trình tự RNA và tiến hóa với một nghiên cứu lâm sàng để điều tra sự xuất hiện và tác động của vi khuẩn Salmonella Typhi kháng azithromycin, tác nhân gây bệnh thương hàn. Các dự án khác bao gồm tìm hiểu tác động của việc tiếp xúc với thuốc kháng sinh đối với hệ vi sinh vật đường ruột của con người, chuyển gen ngang và sự phát triển của kháng thuốc. Anh cũng đang nghiên cứu về hệ sinh thái và sự tiến hóa của tình trạng giảm độc lực và kháng kháng sinh ở Klebsiella pneumoniae .